Осада
Рыцари прибыли в Алленштейн 16 января 1521 года с войском, состоявшим примерно из 400 пехотинцев, 600 тяжеловооружённых всадников, 400 лёгких всадников и артиллерии. Их встретили небольшие отряды стрелков, целью которых было как можно дольше сдерживать атаку рыцарей. Тевтонские рыцари потребовали, чтобы город сдался, надеясь, что демонстрации силы будет достаточно. Однако Коперник отказался выполнить это требование.
26 января рыцари начали штурм города под предводительством Вильгельма фон Шаумбера у Млынских ворот (Brama Młyńska). Рыцарям удалось подойти к стенам по замёрзшему и прорваться через ворота. Они надеялись застать защитников города врасплох. Однако прозвучала тревога, и польские солдаты бросились к пролому в воротах. По словам Ежи Сикорского (польского историка, сыгравшего важную роль в обнаружении могилы Коперника), Коперник, вероятно, вышел на стены и лично руководил обороной города поляками. Атака была отбита, и тевтонские рыцари были вынуждены отступить.
К концу февраля, с прибытием дополнительных подкреплений из Эльблонга, тевтонские рыцари были вынуждены снять осаду. К концу 1521 года из-за нехватки средств для продолжения войны и угрозы приближения большой польской армии они были вынуждены вести переговоры с польским королём.Коперник представлял польскую сторону на переговорах о перемирии. Это был последний раз, когда тевтонские рыцари вторглись в Вармию.
