По версии следствия, Федоров вместе со своим заместителем Еленой Мялкиной, за 2 года «освоили» 18 млн рублей. Ректор и его зам придумали схему денежного поощрения за интенсивность труда сотрудников. Якобы выписывали премии, но деньги клали себе в карман.
При обыске в кабинете Федорова, силовики нашли почти 700 тысяч рублей.